【Gromacs】因为gromacs必须安装cuda（系统自带的NVIDIA驱动不行），这里介绍下如何安装cuda

1. 安装步骤
查看是否安装了cuda

# 法1 cat /usr/local/cuda/version.txt
# 法2 nvcc --version

若没有安装，则查看是否有N卡驱动，若无N卡驱动，则到软件与更新 -> 附加驱动中安装驱动

查看N卡驱动支持的cuda版本

nvidia-smi

如下图支持最高CUDA版本是11.4

2. 到cuda-toolkit-archive，选择需要的CUDA下载CUDA Toolkit 11.4 Downloads | NVIDIA Developer

2.1如下图，选择runfile(local)，并使用生成的指令进行下载和安装

2.2若第1步提示Existing package manager installation of the driver found. It is strongly recommended that you remove this before continuing.，选择continue，然后下一步输入accept，再下一步中去除driver项，之后选择install：

2.2.1.选择continue

2.2.2.输入accept

2.2.3.取消Driver、然后选择Install（敲击空格取消Driver）

设置前：

设置后：

3. 在~/.bashrc文件中添加如下环境变量：

export PATH=/usr/local/cuda-11.4/bin${PATH:+:${PATH}} export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-11.4/lib64${LD_LIBRARY_PATH:+:${LD_LIBRARY_PATH}}

然后 source ~/.bashrc 更新激活环境

4.验证是否安装成功

nvcc -V

5、cudnn安装

网址：cuDNN Archive | NVIDIA Developer

cuDNN Archive | NVIDIA Developer

因为cuda是11.8，所以选择对应的cudnn，我选择的8.5

下载 tar格式

tar -xvf cudnn-linux-x86_64-8.5.0.96_cuda11-archive.tar.xz sudo cp cuda/include/cudnn*.h /usr/local/cuda/include sudo cp -P cuda/lib64/libcudnn* /usr/local/cuda/lib64 sudo chmod a+r /usr/local/cuda/include/cudnn*.h #JJ：根据对应的文件路径修改下路径

验证：
cat /usr/local/cuda/include/cudnn_version.h | grep CUDNN_MAJOR -A 2

出现以下信息说明安装成功：