交互热图通过颜色梯度展示基因、代谢物、微生物等指标在不同样品中的表达量或丰度,并结合样品分组与聚类树,帮助我们快速发现变化趋势和样品差异。这次新版云图汇中新升级的交互热图,新增了非常多实用功能:绘图任务实时监控、绘图模版保存与复用、绘图记录随时查看、绘图参数保存与查看,彻底告别反复调参的麻烦,画热图效率更高,效果更好。
一、新手引导熟悉页面
初次使用时,点击页面上方的“新手引导”。系统会依次突出显示数据文件、参数设置、提交绘图等重要按钮,并说明每一步的作用。对操作流程不熟悉时,可随时重新打开引导。
二、准备与上传数据
1. 数据格式要求
交互热图数据文件为数值矩阵:列代表样品名称,行代表基因、代谢物等指标;分组文件第一列为样品名称,第二列为对应组别。另外,两个文件中的样品名称必须一致。
2. 上传操作
不确定格式时,可点击【示例】查看或【下载】参考数据,按要求整理后再上传。
上传后数据将显示在页面表格中:
表头不可直接编辑;
数据行与数据列支持鼠标按下即可编辑,修改实时保存;数据文件行列过多时,点击【全屏】按钮,修改行列的数据更顺手。
如果需要更换数据重新绘图,点击「清空」就能一键清除内容,之后我们可以上传数据文件,也能直接选用平台提供的示例数据快速体验完整绘图流程。
三、设置参数并提交绘图
平台支持以下数据处理方式:
Z-score、标准化、中心化、Pareto、log10、log2及不处理等方式,并可选择按行或按列处理。设置好后,点击“提交绘图”按钮。
四、绘图任务监控
提交绘图后,可在参数调整区上方的任务监控面板实时追踪进度:任务分为正在运行、运行中、运行失败三类。正在运行无需保留的任务可直接删除,运行成功后点击即可查看绘图结果。
五、图表调整并保存模版
参数调整涵盖以下模块:
模块 | 可调内容 |
画布 | 单元格宽度、高度 |
色彩 | 热图渐变色、分组离散色 |
样式 | 网格线粗细与颜色 |
分组设置 | 是否显示分组 |
模块 | 可调内容 |
聚类树 | 行/列聚类的显示、高度、粗细及颜色 |
行列名 | 支持全部显示和自定义筛选,可展示重点行名或列名 |
主标题 / X轴 / Y轴 / 图例 / 分组图例 | 控制各元素是否显示;字体选择、颜色、字号、大小、字重支持正常、粗体、斜体、粗斜体 |
参数模版
已保存的模版将显示在下拉框中,可直接复用,快速出图;
支持对模版名称进行编辑和删除;
支持一键恢复默认参数。
保存配置
交互图表需点击「保存图片」按钮,系统将自动保存当前全部调整参数。后续可前往【我的项目】→ 新版云图汇随时查看图表的参数配置。
绘图记录列表中,「保存图片」列显示“未保存”时,无法直接查看对应绘图参数。只需要点击该条“未保存”文字,即可跳转至对应绘图页面,点击页面内的「保存图表」按钮完成操作。
六、下载图表与结果
支持导出为 PDF、SVG、PNG、TIFF 四种格式:
模块 | 适用场景 |
PDF / SVG | 排版与后期编辑 |
PNG | 汇报展示 |
TIFF | 期刊投稿 |
💡 PNG 与 TIFF 可设置 DPI,通常选择 300 DPI,具体以期刊投稿要求为准。
百度搜索“派森诺基因云”或直接访问官方网站https://www.genescloud.cn/home,通过导航栏云图汇 → 新版云工具 beta,侧边栏找到【交互热图】模块,选择对应图表,开启您的个性化体验之旅。温馨提示:平台现已正式接入DeepSeek-R1满血版,您可以根据需求切换不同模型进行体验。在绘图过程中,如果遇到常见问题,建议先使用PAI绘图小助手进行自助解决;若有个性化需求或遇到无法解决的问题,欢迎通过【问题反馈】与平台联系,提出您的需求或建议。派森诺基因云始终秉持“持续创新,不断升级”的理念,未来将推出更多精美的可视化图表与实用的分析工具,期待您的使用与反馈!
供稿 | 大数据研发部
编辑 | 市场部
派森诺基因云,由国内外精英硕博团队倾力打造,凭借阿里云的强大的计算与存储优势,致力于为全球科研与医疗领域提供生物信息大数据分析与可视化解决方案。我们整合微生物组、转录组、基因组学、代谢组学、单细胞组学,以及多组学联合等多领域的分析研究,通过个性化定制服务和“一键式”简单操作,降低数据分析的复杂度,加速科研创新的步伐。
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