news 2026/8/15 13:40:52

Knowledge Graph Augmented Large Language Models for Disease Prediction

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张小明

前端开发工程师

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Knowledge Graph Augmented Large Language Models for Disease Prediction

文章核心总结与翻译

一、主要内容

本文针对电子健康记录(EHRs)驱动的疾病预测模型解释性不足、临床实用性有限的问题,提出了一种知识图谱(KG)引导的思维链(CoT)框架。该框架以PrimeKG生物医学知识图谱为基础,通过三阶段实体对齐将ICD-9编码映射到KG节点,挖掘疾病特异性相关节点和推理路径,以此为支架生成时间一致性的CoT解释,并筛选出结论与真实结果匹配的样本,用于微调LLaMA-3.1-Instruct-8B和Gemma-7B等轻量级大语言模型。

在MIMIC-III数据集的10种目标疾病上,模型在仅400和1000个训练样本的小数据场景下,AUROC达到0.66-0.70,macro-AUPR达到0.40-0.47,优于逻辑回归、XGBoost等经典基线模型;在CRADLE数据集上实现零样本迁移,准确率从0.40-0.51提升至0.72-0.77;盲态临床医生评估显示,该框架生成的解释在清晰度、相关性和正确性上均获高度偏好。

二、创新点

  1. KG锚定的CoT生成机制:将生物医学知识图谱的结构化关系融入思维链生成,通过疾病相关路径约束LLM推理,避免无约束生成导致的幻觉和医学错误,确保解释的临床合理性。
  2. 三阶段实体对齐与路径挖掘:提出精确匹配、相似度匹配+LLM验证的ICD-9与PrimeKG节点映射方法,结合最短路径提取和GPT-4o筛选,构建疾病特异性推理路径集合,为解释提供坚实知识支撑。
  3. 数据高效的模型微调:通过标签一致性
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