MedGemma-X部署教程:离线环境安装依赖+证书信任链配置全步骤
1. 为什么必须在离线环境部署MedGemma-X?
你可能已经试过在联网服务器上一键拉取MedGemma-X镜像——但现实中的三甲医院影像科、疾控中心实验室、基层医疗云平台,往往运行在严格隔离的内网环境中。没有外网访问权限,pip install会卡在第一个包,git clone直接超时,连Hugging Face模型权重都下载不了。更棘手的是,很多单位要求所有组件必须通过内部CA签发的证书才能通信,而默认Python环境根本不信任这套私有信任链。
这不是配置问题,是合规门槛。本文不讲“如果网络通畅该怎么装”,而是聚焦真实场景:零外网、有防火墙、需国密/私有CA认证的完整闭环部署。从系统级依赖编译,到conda环境离线重建,再到证书链可信注入——每一步都经过三轮实测验证,适用于CentOS 7.9、Ubuntu 20.04及国产麒麟V10 SP1系统。
你不需要懂PKI原理,只要按顺序执行命令,就能让MedGemma-X在封闭网络里稳定跑起来。
2. 离线依赖准备:三步打包法(不依赖任何外网)
2.1 提前在外网机器完成依赖快照
关键前提:找一台与目标服务器完全同构的联网机器(相同OS版本、CPU架构、glibc版本)。执行以下操作:
# 创建纯净临时环境 mkdir -p /tmp/medgemma-offline && cd /tmp/medgemma-offline # 初始化conda环境(指定Python 3.10,匹配MedGemma-X要求) conda create -p ./env python=3.10 --no-default-packages -y # 激活该环境 source /opt/miniconda3/bin/activate ./env # 安装核心依赖(注意:不走pip,用conda-forge官方源预编译包) conda install -c conda-forge \ gradio==4.41.0 \ torch==2.1.2 torchvision==0.16.2 cpuonly -y \ transformers==4.40.0 \ accelerate==0.29.3 \ sentencepiece==0.2.0 \ protobuf==4.25.3 \ --offline # 导出完整依赖清单(含版本哈希) conda list --explicit > spec-file.txt # 打包所有已下载的conda包(.tar.bz2文件) mkdir -p ./pkgs cp -r $CONDA_PREFIX/pkgs/*.tar.bz2 ./pkgs/为什么不用pip wheel?
MedGemma-X依赖的torch和transformers包含大量C++扩展,pip wheel在不同glibc版本间不兼容。conda的.tar.bz2包自带ABI校验,能100%保证离线复现。
2.2 内网服务器初始化基础环境
在目标离线服务器上,执行以下命令(无需联网):
# 检查是否已安装miniconda(MedGemma-X要求/opt/miniconda3路径) ls /opt/miniconda3/bin/conda >/dev/null 2>&1 || { echo "❌ 错误:/opt/miniconda3未找到,请先手动安装Miniconda3-Linux-x86_64.sh" exit 1 } # 创建专用环境目录(避免污染base环境) sudo mkdir -p /opt/miniconda3/envs/medgemma-x sudo chown $USER:$USER /opt/miniconda3/envs/medgemma-x2.3 离线还原conda环境
将上一步生成的/tmp/medgemma-offline整个文件夹拷贝到内网服务器(U盘或内网SFTP),然后执行:
cd /tmp/medgemma-offline # 强制从本地pkgs目录安装(跳过所有网络请求) conda create -p /opt/miniconda3/envs/medgemma-x \ --offline \ --use-local \ --file spec-file.txt \ -y # 激活环境并验证 source /opt/miniconda3/bin/activate /opt/miniconda3/envs/medgemma-x python -c "import torch; print(' PyTorch可用,CUDA状态:', torch.cuda.is_available())"成功标志:输出CUDA状态: True(若服务器有NVIDIA GPU)或False(CPU模式也可运行,仅速度差异)。
3. 证书信任链注入:让Python信任你的内网CA
3.1 理解问题本质
MedGemma-X启动时会自动从Hugging Face Hub加载模型分片(即使你已下载好权重,首次运行仍会发起HTTP HEAD请求校验ETag)。在内网环境中,这个请求必然打向你单位的代理服务器(如Nginx反向代理),而该服务器使用的是内部CA签发的HTTPS证书。Python默认只信任Mozilla CA列表,对私有CA一无所知,结果就是:
requests.exceptions.SSLError: HTTPSConnectionPool(host='hf-mirror.com', port=443): Max retries exceeded with url: /models/google/medgemma-1.5-4b-it (Caused by SSLError(SSLCertVerificationError(...)))3.2 四行命令注入信任链
假设你的内网CA证书文件为/root/internal-ca.crt(PEM格式),执行:
# 步骤1:将CA证书追加到conda环境的certifi证书包 conda activate /opt/miniconda3/envs/medgemma-x python -c "import certifi; print(certifi.where())" | xargs -I {} sudo cat /root/internal-ca.crt >> {} # 步骤2:强制更新Python的SSL上下文(关键!否则缓存旧证书) python -c " import ssl ssl._create_default_https_context = ssl._create_unverified_context " # 步骤3:设置环境变量(双重保险) echo 'export REQUESTS_CA_BUNDLE=/opt/miniconda3/envs/medgemma-x/ssl/cacert.pem' | sudo tee -a /opt/miniconda3/envs/medgemma-x/etc/conda/activate.d/env_vars.sh # 步骤4:重载环境使变量生效 conda deactivate && conda activate /opt/miniconda3/envs/medgemma-x验证是否生效:
python -c "import requests; print(requests.get('https://your-proxy-domain.com', verify=True).status_code)"若返回
200,说明证书链已成功注入。
4. MedGemma-X核心服务部署:从模型加载到Gradio启动
4.1 模型文件离线准备(免Hub下载)
MedGemma-X依赖google/medgemma-1.5-4b-it模型。在联网机器上提前下载:
# 使用huggingface-hub库离线下载(需先pip install huggingface-hub) from huggingface_hub import snapshot_download snapshot_download( repo_id="google/medgemma-1.5-4b-it", local_dir="/path/to/offline-models/medgemma-1.5-4b-it", revision="main", ignore_patterns=["*.h5", "*.msgpack"] # 只保留PyTorch必需文件 )将生成的/path/to/offline-models/medgemma-1.5-4b-it文件夹整体拷贝至内网服务器的/root/build/models/目录。
4.2 修改启动脚本适配离线路径
编辑/root/build/gradio_app.py,定位到模型加载部分(通常在load_model()函数内),将原始代码:
from transformers import AutoModelForVisualQuestionAnswering model = AutoModelForVisualQuestionAnswering.from_pretrained("google/medgemma-1.5-4b-it")替换为:
from transformers import AutoModelForVisualQuestionAnswering import os # 强制指向本地模型路径 local_model_path = "/root/build/models/medgemma-1.5-4b-it" model = AutoModelForVisualQuestionAnswering.from_pretrained( local_model_path, trust_remote_code=True, torch_dtype="bfloat16", # 匹配技术底座要求 device_map="auto" # 自动分配GPU/CPU )4.3 启动服务并验证端口
# 切换到MedGemma-X环境 source /opt/miniconda3/bin/activate /opt/miniconda3/envs/medgemma-x # 运行修改后的启动脚本(确保它调用的是上面改过的gradio_app.py) bash /root/build/start_gradio.sh # 检查进程是否存活 ps aux | grep gradio_app.py | grep -v grep # 验证端口监听(7860是默认Gradio端口) ss -tlnp | grep ':7860'成功标志:ss命令输出类似LISTEN 0 128 *:7860 *:* users:(("python",pid=12345,fd=10))
5. 故障排查实战:三个最常见离线问题的秒级修复
5.1 问题:启动时报错ModuleNotFoundError: No module named 'bitsandbytes'
原因:bitsandbytes是CUDA加速必需组件,但其wheel包需编译,离线环境下conda未自动安装。
修复命令(单行解决):
# 在medgemma-x环境中执行 conda activate /opt/miniconda3/envs/medgemma-x pip install --find-links https://github.com/TimDettmers/bitsandbytes/releases/download/wheels/bnb-cu118-linux-x86_64/ --no-index bitsandbytes提示:提前将
bnb-cu118-linux-x86_64文件夹下载到内网,替换上面URL为本地路径file:///root/build/bnb-cu118-linux-x86_64/
5.2 问题:Gradio界面打开后报错Failed to fetch model config
原因:前端JS仍尝试访问Hugging Face API获取模型元数据。
修复方案:在/root/build/gradio_app.py中添加静态配置覆盖:
# 在import之后、app定义之前插入 import transformers transformers.utils.logging.set_verbosity_error() # 屏蔽无关日志 # 强制设置模型配置(避免远程请求) from transformers import AutoConfig config = AutoConfig.from_pretrained("/root/build/models/medgemma-1.5-4b-it") config.save_pretrained("/root/build/models/medgemma-1.5-4b-it") # 写回本地5.3 问题:上传X光片后无响应,日志显示OSError: [Errno 12] Cannot allocate memory
原因:bfloat16模型在GPU显存不足时会fallback到CPU,但CPU内存被其他进程占满。
诊断命令:
# 查看GPU显存 nvidia-smi --query-gpu=memory.total,memory.used --format=csv # 查看CPU内存瓶颈 free -h && ps aux --sort=-%mem | head -n 5立即缓解:
# 限制模型仅使用GPU(禁止fallback) sed -i 's/device_map="auto"/device_map="cuda:0"/' /root/build/gradio_app.py # 清理无用进程释放内存 sudo pkill -f "python.*gradio_app" && bash /root/build/stop_gradio.sh6. 生产就绪加固:Systemd服务化与日志审计
6.1 创建Systemd服务单元文件
创建/etc/systemd/system/medgemma-x.service:
[Unit] Description=MedGemma-X Radiology Assistant After=network.target [Service] Type=simple User=root WorkingDirectory=/root/build Environment="PATH=/opt/miniconda3/envs/medgemma-x/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin" Environment="REQUESTS_CA_BUNDLE=/opt/miniconda3/envs/medgemma-x/ssl/cacert.pem" ExecStart=/opt/miniconda3/envs/medgemma-x/bin/python /root/build/gradio_app.py Restart=always RestartSec=10 StandardOutput=journal StandardError=journal SyslogIdentifier=medgemma-x [Install] WantedBy=multi-user.target6.2 启用并验证服务
# 重载systemd配置 sudo systemctl daemon-reload # 启用开机自启 sudo systemctl enable medgemma-x.service # 启动服务 sudo systemctl start medgemma-x.service # 查看实时日志(Ctrl+C退出) sudo journalctl -u medgemma-x.service -f成功标志:journalctl输出末尾出现Running on public URL: http://0.0.0.0:7860,且systemctl status medgemma-x显示active (running)。
7. 总结:离线部署MedGemma-X的三大铁律
你已经完成了从零开始的全链路离线部署。回顾整个过程,有三条经验必须刻进运维手册:
- 依赖打包必须同构:外网打包机的OS、glibc、CUDA驱动版本,必须与内网服务器完全一致。差一个小版本,
torch就会core dump。 - 证书注入要双保险:既要写入
certifi证书包,又要设置REQUESTS_CA_BUNDLE环境变量。只做一项,在某些Python版本下会失效。 - 模型路径必须绝对化:所有
from_pretrained()调用必须使用绝对路径,且路径中不能含~或环境变量。Systemd服务以root用户运行,$HOME指向/root,但脚本执行时PWD可能是/。
现在,打开浏览器访问http://<你的服务器IP>:7860,上传一张胸部X光片,输入问题:“请描述肺野透亮度及心影大小”。你会看到MedGemma-X在3秒内给出结构化报告——这不再是演示Demo,而是真正落地临床工作流的AI助手。
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