【数据库】spatialLIBD

最近发现了一个时空组学数据网站spatialLIBD。

地址：spatialLIBD: an R/Bioconductor package to visualize spatially-resolved transcriptomics data • spatialLIBD

spatialLIBD（v1.23.0）是由 Lieber Institute for Brain Development（LIBD）开发并维护的一个集空间转录组数据共享、交互式可视化与分析于一体的研究平台。该项目围绕人类背外侧前额叶皮层（DLPFC）的空间转录组数据展开，数据基于10x Genomics Visium平台生成，覆盖六层皮层结构及白质区域，包含多位受试者及空间相邻的生物学重复样本。

spatialLIBD 同时提供：

1. 在线 Shiny 网页应用（spatial.libd.org/spatialLIBD），支持用户在浏览器中交互式探索基因在空间与皮层层级上的表达分布；

2. R/Bioconductor 软件包（spatialLIBD），允许用户在本地环境中下载、处理和可视化官方数据或自有 Visium 数据；

3. 配套研究论文与完整分析代码，系统展示了 DLPFC 空间转录组的分层结构、基因表达特征及统计建模结果。